Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNRPBP14678 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms