Protein–RNA interactions for Protein: P13765

HLA-DOB, HLA class II histocompatibility antigen, DO beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DOBP13765 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HLA-DOBP13765 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HLA-DOBP13765 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms