Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AP000692.2-201ENST00000608391 879 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
GP1BBP13224 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms