Protein–RNA interactions for Protein: P0DP24

CALM2, Calmodulin-2, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALM2P0DP24 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CALM2P0DP24 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CALM2P0DP24 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.9 ms