Protein–RNA interactions for Protein: P0DP09

IGKV1-13, Immunoglobulin kappa variable 1-13, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-13P0DP09 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 RN7SL471P-201ENST00000580476 299 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
IGKV1-13P0DP09 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms