Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI9

SAA2, Serum amyloid A-2 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA2P0DJI9 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SAA2P0DJI9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms