Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C4BP0C0L5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C4BP0C0L5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms