Protein–RNA interactions for Protein: P07199

CENPB, Major centromere autoantigen B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPBP07199 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CENPBP07199 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CENPBP07199 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CENPBP07199 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CENPBP07199 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CENPBP07199 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CENPBP07199 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms