Protein–RNA interactions for Protein: P05423

POLR3D, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3DP05423 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
POLR3DP05423 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
POLR3DP05423 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60 ms