Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 LINC01842-201ENST00000588275 768 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
SPTA1P02549 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms