Protein–RNA interactions for Protein: P01920

HLA-DQB1, HLA class II histocompatibility antigen, DQ beta 1 chain, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DQB1P01920 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
HLA-DQB1P01920 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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