Protein–RNA interactions for Protein: O94874

UFL1, E3 UFM1-protein ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 794 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFL1O94874 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UFL1O94874 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
UFL1O94874 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
UFL1O94874 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms