Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
EFNA2O43921 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms