Protein–RNA interactions for Protein: O43761

SYNGR3, Synaptogyrin-3, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR3O43761 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 FGFBP3-201ENST00000311575 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
SYNGR3O43761 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SYNGR3O43761 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms