Protein–RNA interactions for Protein: O15240

VGF, Neurosecretory protein VGF, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VGFO15240 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
VGFO15240 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VGFO15240 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VGFO15240 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VGFO15240 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VGFO15240 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
VGFO15240 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
VGFO15240 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
VGFO15240 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
VGFO15240 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
VGFO15240 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
VGFO15240 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VGFO15240 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VGFO15240 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
VGFO15240 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VGFO15240 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VGFO15240 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
VGFO15240 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms