Protein–RNA interactions for Protein: H3BVE0

BOLA2-SMG1P6, BOLA2-SMG1P6 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IRAK1-203ENST00000369980 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
BOLA2-SMG1P6H3BVE0 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms