Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
LIPT2A6NK58 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 TSPAN14-202ENST00000341863 1037 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
LIPT2A6NK58 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms