Protein–RNA interactions for Protein: A6NI47

POTEM, Putative POTE ankyrin domain family member M, humanhuman

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POTEMA6NI47 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
POTEMA6NI47 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms