Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PRAMEF25A6NGN4 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms