Protein–RNA interactions for Protein: A6NGH7

CCDC160, Coiled-coil domain-containing protein 160, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC160A6NGH7 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
CCDC160A6NGH7 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
CCDC160A6NGH7 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms