Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

Predictions only

Length 438 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC18.78■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
CCDC78A2IDD5 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
CCDC78A2IDD5 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms