Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
NUBP2Q9Y5Y2 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NUBP2Q9Y5Y2 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms