Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
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SNX13Q9Y5W8 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
SNX13Q9Y5W8 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
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