Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Q4

HCN4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCN4Q9Y3Q4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 PFKFB3-219ENST00000640683 2311 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
HCN4Q9Y3Q4 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
HCN4Q9Y3Q4 CIRBP-225ENST00000589710 1835 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms