Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B1

PRELID3B, PRELI domain containing protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRELID3BQ9Y3B1 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TRIL-201ENST00000539664 4935 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PRELID3BQ9Y3B1 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms