Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2W7

KCNIP3, Calsenilin, humanhuman

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP3Q9Y2W7 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ARHGAP27-201ENST00000290470 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 ATRNL1-201ENST00000355044 8479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
KCNIP3Q9Y2W7 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
KCNIP3Q9Y2W7 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms