Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SBNO2Q9Y2G9 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SBNO2Q9Y2G9 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms