Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2E6

DTX4, E3 ubiquitin-protein ligase DTX4, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX4Q9Y2E6 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DTX4Q9Y2E6 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms