Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULC3

RAB23, Ras-related protein Rab-23, humanhuman

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Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB23Q9ULC3 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 SBDS-201ENST00000246868 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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RAB23Q9ULC3 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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RAB23Q9ULC3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
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RAB23Q9ULC3 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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RAB23Q9ULC3 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 KRT73-AS1-202ENST00000551089 563 ntTSL 4 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
RAB23Q9ULC3 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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