Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKE5

TNIK, TRAF2 and NCK-interacting protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNIKQ9UKE5 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TNIKQ9UKE5 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
TNIKQ9UKE5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms