Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJY4

GGA2, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA2, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA2Q9UJY4 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 TEX13A-202ENST00000609007 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
GGA2Q9UJY4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms