Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI33

SCN11A, Sodium channel protein type 11 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,791 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN11AQ9UI33 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SCN11AQ9UI33 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SCN11AQ9UI33 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms