Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGL1

KDM5B, Lysine-specific demethylase 5B, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5BQ9UGL1 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
KDM5BQ9UGL1 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
KDM5BQ9UGL1 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms