Protein–RNA interactions for Protein: Q9UF33

EPHA6, Ephrin type-A receptor 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA6Q9UF33 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
EPHA6Q9UF33 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
EPHA6Q9UF33 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms