Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBB5

MBD2, Methyl-CpG-binding domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD2Q9UBB5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PITPNM2-208ENST00000542749 6660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SLC4A2-214ENST00000485713 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PPM1F-203ENST00000407142 5587 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
MBD2Q9UBB5 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
MBD2Q9UBB5 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms