Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2R6

RERE, Arginine-glutamic acid dipeptide repeats protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,566 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REREQ9P2R6 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
REREQ9P2R6 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
REREQ9P2R6 HIST2H3D-201ENST00000331491 411 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms