Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR1

TMOD2, Tropomodulin-2, humanhuman

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD2Q9NZR1 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 MTSS1L-201ENST00000338779 4992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TMOD2Q9NZR1 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
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