Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZN5

ARHGEF12, Rho guanine nucleotide exchange factor 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF12Q9NZN5 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
ARHGEF12Q9NZN5 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
ARHGEF12Q9NZN5 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms