Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ63

C9orf78, Telomere length and silencing protein 1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf78Q9NZ63 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
C9orf78Q9NZ63 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
C9orf78Q9NZ63 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms