Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYF3

FAM53C, Protein FAM53C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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FAM53CQ9NYF3 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
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FAM53CQ9NYF3 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
FAM53CQ9NYF3 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
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FAM53CQ9NYF3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
FAM53CQ9NYF3 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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