Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

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Length 342 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
HOXC10Q9NYD6 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
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HOXC10Q9NYD6 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
HOXC10Q9NYD6 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
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