Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VNN3Q9NY84 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms