Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ5

PGPEP1, Pyroglutamyl-peptidase 1, humanhuman

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGPEP1Q9NXJ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AC124242.1-203ENST00000517747 817 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
PGPEP1Q9NXJ5 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.4□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AVL9-201ENST00000318709 6982 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC007041.1-201ENST00000438989 1155 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC113382.2-201ENST00000506911 646 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC026616.1-201ENST00000523157 525 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 UBALD1-209ENST00000591897 1275 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC006387.1-201ENST00000626365 671 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 CAPZB-205ENST00000433834 1462 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 MADCAM1-201ENST00000215637 1572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 TUSC2-201ENST00000232496 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
PGPEP1Q9NXJ5 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms