Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW13

RBM28, RNA-binding protein 28, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM28Q9NW13 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RBM28Q9NW13 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
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