Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVD7

PARVA, Alpha-parvin, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARVAQ9NVD7 LONRF1-208ENST00000533751 3043 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
PARVAQ9NVD7 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
PARVAQ9NVD7 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms