Protein–RNA interactions for Protein: Q9NST1

PNPLA3, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA3Q9NST1 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
PNPLA3Q9NST1 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65 ms