Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSI8

SAMSN1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMSN1Q9NSI8 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
SAMSN1Q9NSI8 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SAMSN1Q9NSI8 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms