Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRX5

SERINC1, Serine incorporator 1, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERINC1Q9NRX5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
SERINC1Q9NRX5 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC211429.1-201ENST00000415277 523 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
SERINC1Q9NRX5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms