Protein–RNA interactions for Protein: Q9NNZ6

PRM3, Protamine-3, humanhuman

Predictions only

Length 103 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRM3Q9NNZ6 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PSEN1-203ENST00000394157 1249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 OPA1-205ENST00000361908 6439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PRM3Q9NNZ6 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms