Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7N4

SCAF1, Splicing factor, arginine/serine-rich 19, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF1Q9H7N4 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 PKIB-206ENST00000392490 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SCAF1Q9H7N4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AC091917.2-201ENST00000505002 744 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC27.57■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AC009712.1-201ENST00000564938 316 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CATSPER2-201ENST00000321596 1820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SCAF1Q9H7N4 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms